在医疗行业，激光器用于直接用于病人治疗的设备（如眼科和诊断程序）和用于生产医疗设备，如可植入设备（心脏起搏器，放射性治疗癌症“种子” ，支架，等）和工具（动脉瘤钳，骨锯，解剖刀，等）。激光微切割是手术设备和医疗植入物生产中的领先技术。

        医疗设备通常都相当小，这有两个基本原因。一是它们常要在很小的空间工作，一是由昂贵的材料制成，尺寸小就是节约成本。激光可以在要求公差仅为几微米的范围内工作，是生产体积小，成本低的设备的理想解决方案。在医疗设备行业最需要微切割设备大概就是内支架的切割。血管内支架是一个微小的，栅格状的金属管，被永久植入动脉。血管内支架帮助打开动脉使血液流动能够畅通。血管内支架是圆柱形金属架植入患病冠状动脉，用于恢复血液流量。用于内支架的材料可以是316L不锈钢或镍钛合金（形状记忆合金）。通常管直径在1mm到10mm之间，管壁厚度大约10um。关键要求截口宽度要小（20-30um），这就要求高光束质量，和高的激光功率稳定性。激光切割结果表面质量高，热响应区小，无碎屑。图像显示的是一个经过切割和清洁的常用内支架在经过超声波浴的SEM显微图片。采用JK光纤系列，无碎屑切割（20um宽）可以实现很高的轮廓精度（<5um）实现。0.5mm厚的316L不锈钢单模激光输出的典型切割速度为500mm/min。

       目前，在医疗领域中，激光微切割主要应用于内支架，但是，在针切割中的进步也表明激光器在设计使用上还有更大的潜力。